测序平台

来源:安徽医科大学皮肤病研究所发布时间:2019-05-27浏览次数:10

        Hiseq 3000测序系统

        Hiseq 3000高通量测序系统在可靠的HiSeq 2500的基础上使用了创新的有序流动槽技术,可提高测序速度和测序质量。在3-4天时间内可获得750Gb的数据量,可以开展全基因组、外显子组、转录组等测序。每个run可完成6个人类全基因测序(30X coverage),90个人类全外显子测序(100X coverage),50个样本的全基因组转录组测序(100X coverage)。(陈刚)

        应用:基因组测序,外显子测序,转录组测序,靶向捕获测序,基因组甲基化测序等


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        Ion Torrent测序平台介绍

        Ion Torrent测序的核心技术是使用半导体技术在化学和数字信息之间建立直接的联系。在半导体芯片的微孔中的微球上固定DNA链,随后依次掺入ACGT。随着每个碱基的掺入,释放出氢离子,在它们穿过每个孔底部时能被检测到,通过对H+ 的检测,实时判读碱基。Ion Torrent由于硬件设备无需光学检测和扫描系统,并且使用天然核苷酸和聚合酶、无需焦磷酸酶化学级联,无需标记荧光染料和化学发光的配套试剂,因此测序成本低,其应用范围涵盖Sanger方法和已有高通量测序技术的应用,如基因组DNA序列测定、DNA扩增子测序等。其应用灵活通量为10M,100M和1G测序芯片可以任意选择。(李攀)

        应用:微生物基因组测序、线粒体测序、靶向测序


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        ABI3730XL测序平台简介

        ABI3730xl测序平台于2010年9月在安医大一附院皮肤病研究所创立并且开展应用至今。Applied Biosystems 3730XL测序仪平台是高质量的长片段读取和序列分析的测序平台,可用于DNA序列片段的检测,在DNA序列片段中寻找突变等,应用灵活而广泛。3730XL可同时分析96个样品,该仪器采用4色荧光同时检测,自动灌胶,上样,电泳分离,检测及数据分析。

        ABI3730XL自动测序仪是基于毛细管电泳和荧光标记技术的DNA测序仪。基于Sanger法,3730XL测序仪拥有96道毛细管,并用荧光标记代替了同位素标记,从而大大提高了DNA测序的速度和准确性。4种双脱氧核苷酸(ddNTP)的碱基分别用不同的荧光进行标记,在通过毛细管时不同长度的DNA片段上的4种荧光基团被激光激发,发出不同颜色的荧光,被CCD检测系统识别,并直接翻译成DNA序列。(朱俊)

        应用:短片度DNA序列测定(200-1000bp之间)


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