生物信息学分析平台

来源:安徽医科大学皮肤病研究所发布时间:2019-05-27浏览次数:10

已有数据:

1、测序数据

全外显子测序数据(700对照,800银屑病);10数种单基因病家系全基因组外显子测序数据;银屑病候选基因靶向捕获测序(10000银屑病,10000对照)

2、GWAS芯片数据

A、illumina中华芯片数据:银屑病:1139;白癜风:1117;系统性红斑狼疮:1047;过敏性皮炎:1012;乳癌:1533;对照:>5000;

B、Illumina亚洲芯片数据:银屑病:11245;乳癌:8035;系统性红斑狼疮:5000;对照:>10000;

C、验证平台数据Sequenom及Taqman数据

3、RNA测序数据: 60例样本RNA测序数据

4、甲基化数据:240例Illumina 450k甲基化芯片数据

 

可做的数据分析

1、传统的linkage数据分析;2、GWAS研究;3、单基因病家系测序数据分析;4、注释与预测;(郑晓冬); 5、高通量测序数据分析;